Подготовка докторантов реализуется очным обучением сроком не более трех лет. Поступление в докторантуру не носит конкурсной основы. В качестве докторантов могут быть оформлены те граждане РА, которые имеют научную степень кандидата наук и занимаются научной деятельностью, имеют определенные научные результаты. За время пребывания в докторантуре докторант должен выполнить предусмотренные по индивидуальной программе работы, закончить диссертацию доктора наук и провести в Академии предварительное обсуждение диссертации (защиту). Докторантам выплачивается гос.стипендия и предоставляется двух месячный отпуск каждый год с сохранением стипендии.
Докторанты, аспиранты и заявители в Академии бесплатно пользуются техническими средствами обучения, компьютерной техникой и библиотекой.